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Die Doktorandinnen und Doktoranden des Promotionskollegs

Promotionskolleg IPMB der Universität Tübingen und Hochschule Reutlingen

Intelligente Prozess- und Materialentwicklung in der Biomateriomics

Das kooperative Promotionskolleg IPMB ist ein Zusammenschluss von Forschungsgruppen aus dem Bereich Polymerchemie, Biomaterialien, physikalisch-chemischer Analytik, Informatik sowie Zellbiologie und Tissue Engineering. Zentrales Ziel des interdisziplinären Kollegs ist es, einen wesentlichen Beitrag zur Entwicklung von funktionsspezifischen Oberflächen von Werkstoffen für Anwendungen in der Medizintechnik und Zelldiagnostik zu leisten.

Schematische Darstellung zum Vorgehen bei der „Systematischen Biomaterialentwicklung“
Schematische Darstellung zum Vorgehen bei der „Systematischen Biomaterialentwicklung“

Das Kolleg wird vom Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kunst des Landes Baden-Württemberg gefördert. Zwölf Stipendiaten arbeiten gemeinsam an den Kollegstandorten Tübingen und Reutlingen an chemischen, physikalischen und medizinischen Fragestellungen der modernen Biomaterialforschung.

Promovierende am Standort Reutlingen

Kerstin Frey

Kerstin Frey, M.Sc.

Entwicklung von Biomaterial-Chips mit vielfältigen definierten Oberflächeneigenschaften

  • Biomaterialien
  • Oberflächen- Modifikationen
  • Zell-Material-Interaktion
  • Altersabhängiges Zellverhalten

Gebäude 2
Raum 011
Tel. 07121 271-1494
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Publikationen

Paper:

  • Sarah Biela, Britta Streigl, Kerstin Frey, Joachim P. Spatz & Ralf Kemkemer. Distand-dependent adhesion of vascular cells on biofunctionalized gold nanostrucutres, Current Directions in Biomedical Engineering 2017; 3(2): 683-686; DOI: 10.1515/cdbme-2017-0144
  • Kerstin Frey, Alena Fischer, Rumen Krastev & Ralf Kemkemer. CurvChip – chip platform for investigating cell responses to curved surface features. Current directions in Biomedical Engineering 2018; 4(1): 453-456; DOI: 10.1515/cdbme-2018-0108

Poster:

  • Sarah Biela, Britta Streigl, Kerstin Frey, Joachim P. Spatz & Ralf Kemkemer. Distand-dependent adhesion of vascular cells on biofunctionalized gold nanostrucutres; Jahrestagung der Biomedizinischen Technik und Dreiländertagung der Medizinischen Physik, 10. – 13. September 2017, Dresden
  • Kerstin Frey, Markus Schneider, Kiriaki Athanasopulu, Rumen Krastev & Ralf Kemkemer. Development of a chip-platform for investigating cellular response to surface curvature; Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomaterialien, 09. – 11.11. 2017, Würzburg; Abstract veröffentlicht unter: Biomed. Eng. - Biomed. Tech. 2017; 62(s2): 90-p228; DOI 10.1515/bmt-2017-6016
  • Kerstin Frey, Markus Schneider, Kiriaki Athanasopulu, Rumen Krastev & Ralf Kemkemer. Chip-Platform for the systematic investigation of cellular response to 3D curvature; Wold Congress of Biomechanics 8.-12. Juli 2018, Dublin Irland

  • Kerstin Frey, Alena Fischer, Rumen Krastev & Ralf Kemkemer. CurvChip – chip platform for investigating cell responses to curved surface features; Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik, 26. – 28. September 2018, Aachen

Simon Grützmacher

Simon Grützmacher, M.Sc.

Selbstoptimierender, lernender Prozessanalyse- und Synthese-Ansatz zur Optimierung der Herstellung von bio-kompatiblen Materialien

  • Maschinelles Lernen
  • Computer Vision
  • Prozessoptimierung

Gebäude 2
Raum 011
Tel. 07121 271-1495
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Svenja Nellinger

Svenja Nellinger, M.Sc.

Thematische Schwerpunkte:

  • Extrazelluläre Matrix
  • Zell-Material-Interaktion
  • Biomaterialien
  • Spektroskopische Zellcharakterisierung

Gebäude 2
Raum 011
Tel. 07121 271-1492
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Publikationen

Adipose stem cell-derived Extracellular Matrix represents a promising Biomaterial by inducing spontaneous formation of Prevascular-like Structures by MvECs
Svenja Nellinger, Isabelle Schmidt, Simon Heine, Ann-Cathrin Volz and Petra J. Kluger
Biotechnology and Bioengineering. 2020;1–13.
DOI: 10.1002/bit.27481

An Advanced “clickECM” that Can be Modified by the Inverse-Electron Demand Diels-Alder Reaction
Svenja Nellinger, Mareike A. Rapp, Dr. Alexander Southan, Prof. Dr. Valentin Wittmann, Prof. Dr. Petra J. Kluger
ChemBioChem. 2021
https://doi.org/10.1002/cbic.202100266

Generation of an azide-modified extracellular matrix by adipose-derived stem cells using metabolic glycoengineering
Svenja Nellinger*, Silke Keller, Alexander Southan, Valentin Wittmann, Ann-Cathrin Volz and Petra J. Kluger
Current Directions in Biomedical Engineering

Cell-derived Extracellular Matrix as maintaining Biomaterial for adipogenic differentiation
Svenja Nellinger, Simon Heine, Ann-Cathrin Volz and Petra J. Kluger*
Current Directions in Biomedical Engineering
https://doi.org/10.1515/cdbme-2020-3106

Vita

2016 – heute

Promotion: Biologie, Universität Tübingen, Kooperatives Promotionskolleg Tübingen-Reutlingen, Thema: Hochdurchsatzerfassung von Zell-Material-Interaktion mittels Biomaterial Chip (an der Hochschule Reutlingen)

2014 – 2016

Master: Biologie (Schwerpunkt Physiologie), Universität Hohenheim, Thema: Completely defined adipogenic differentiation of adipose-derived stem cells and their validation as testing system (an der Hochschule Reutlingen)

2010 – 2014

Bachelor: Ernährungswissenschaften, Universität Hohenheim, Thema: Einfluss von Probiotika auf nicht-alkoholbedingte Fettlebererkrankungen

Projekte

Projekt:

ViaZell

Miriam Bassler

Miriam Bassler, M.Sc.

Analytik Materialien und Herstellungsprozesse

  • Raman-Spektroskopie
  • Spektrales Imaging
  • Spektroskopische Zellcharakterisierung

Gebäude 2
Raum 011
Tel. 07121 271-1490
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Mona Stefanakis

Mona Stefanakis, M.Sc.

Entwicklung von in-vitro Hochdurchsatz-Screening-System

  • Multimodales Imaging
  • Optische Spektroskopie und Mikroskopie
  • Hochdurchsatz Biomaterial Screening und Diagnostik
  • Multivariate Datenanalyse und statistische Versuchsplanung

Gebäude 1a
Raum 003
Tel. 07121 271-1456
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Publikationen

Paper:

  • Al Ktash, M.; Stefanakis, M.; Boldrini, B.; Ostertag, E.; Brecht, M. Characterization of Pharmaceutical Tablets Using UV Hyperspectral Imaging as a Rapid In-Line Analysis Tool. Sensors2021, 21, 4436. https://doi.org/10.3390/s21134436
  • M. Stefanakis, A. Lorenz, J. W. Bartsch, M. C. Bassler, A. Wagner, M. Brecht, A. Pagenstecher, J. Schittenhelm, B. Boldrini, S. Hakelberg, S. Noell, C. Nimsky, M. Tatagiba, R. Ritz, K. Rebner, E. Ostertag, Formalin Fixation as Tissue Preprocessing for Multimodal Optical Spectroscopy Using the Example of Human Brain Tumour Cross Sections. Journal of Spectroscopy, vol. 2021, Article ID 5598309, 14 pages, 2021. https://doi.org/10.1155/2021/5598309
  • Ulitzsch, S., Bäuerle, T., Stefanakis, M., Brecht, M., Chassé, T., Lorenz, G., Kandelbauer, A., Synthesis of an Addition-Crosslinkable, Silicon-Modified Polyolefin via Reactive Extrusion Monitored by In-Line Raman Spectroscopy. Polymers 2021, 13, 1246. https://doi.org/10.3390/polym13081246
  • E. Ostertag, M. Stefanakis, K. Rebner, R. W. Kessler, Elastic and inelastic light scattering spectroscopy and its possible use for label-free brain tumor typing, Anal Bioanal Chem, 2017; DOI 10.1007/s00216-017-0614-1

Vorträge:

  • M. Stefanakis, E. Ostertag, K. Rebner, Multimodale optische Spektroskopie zur markierungsfreien Charakterisierung von Tumoren, 10. interdisziplinäres Doktorandenseminar, 28.-29.02., 01.03.2016, Berlin, Deutschland
  • M. Stefanakis, T. Krawietz, I. Sequeira, J. W. Bartsch, G. Koller, F. Watt, K. Rebner, E. Ostertag, Labelfree multimodal micro-spectroscopic differentiation of dysplasia stages in mouse tongues as a model of early tumor genesis in head and neck squamous cell carcinoma combined with multivariate data analysis, SPAOM 2016, 05.-07.10.2016, Bilbao, Spanien
  • M. Stefanakis, T. Krawietz, I. Sequeira, J. W. Bartsch, G. Koller, F. Watt, K. Rebner, E. Ostertag, Detektion und Klassifizierung von frühen Tumorstadien im Mausmodell mittels markierungsfreier multimodaler optischer Spektroskopie, 11. interdisziplinäres Doktorandenseminar, 12.-14.03.2016, Berlin, Deutschland
  • M. Stefanakis, T. Krawietz, A. Karpa, I. Sequeira, J. W. Bartsch, G. Koller, F. Watt, K. Rebner, E. Ostertag, Labelfree multimodal optical spectroscopy for digital pathology in head and neck cancer, ANAKON 2017, 03.-07.04.2017, Tübingen, Deutschland
  • M. Stefanakis, E. Ostertag, M. Brecht, K. Rebner, Optical Spectroscopy and Multivariate Data Analysis for Digital Pathology – What do PAT and Point-of-Care Testing have in common?, Analytica Conference 2018, 10.-12.04.2018, München, Deutschland

 

Poster:

  • M. Stefanakis, E. Ostertag, M. Scholz, A. Karpa, M. Alktash, A. Lorenz, I. Sequeira, K. Rebner, A. J. Meixner, M. Brecht, High throughput screening for a label-free early stage diagnosis and demarcation of head and neck cancer in a mouse model, Workshop: Interdisciplinary perspectives in biomateriomics – Processing, Characterization & Applications, 18.-21.02.19 Insel Reichenau, Deutschland
  • M. Stefanakis, E. Ostertag, K. Rebner, A. J. Meixner, M. Brecht, Infrared spectroscopy and multivariate data analysis for the labelfree early stage diagnosis and demarcation of head and neck cancer in a mouse model, Scandinavian Symposium on Chemometrics (SSC16) 2019, 17.-20.06.2019, Oslo, Norway
  • T. Drieschner, M. Stefanakis, A. Lorenz, B. Boldrini, K. Rebner, Monitoring of Cell Cultivation via Fluorescence Spectroscopy, 11. Kolloquium Prozessanalytik, 01.-02.12.2015, Wien, Österreich
  • M. Stefanakis, E. Ostertag, S. Luckow-Markgraf, R. W. Kessler, K. Rebner, Labelfree high content screening based on multimodal spectroscopic imaging for point-of-care biomedical diagnosis and digital pathology, EuroPACT 2017, 10.-12.05.2017, Potsdam, Deutschland
  • M. Stefanakis, E. Ostertag, M. Brecht, A. Lorenz, K. Rebner, PAT 4.0  – Chancen und Herausforderungen für die Digitale Pathologie, 13. Kolloquium Prozessanalytik, 20.-22.11.2017, Esslingen, Deutschland
  • M. Stefanakis, E. Ostertag, A. Lorenz, M. Brecht, K. Rebner, Multimodal optical spectroscopy and multivariate data analysis for the demarcation of human brain tumors, 17th Chemometrics in Analytical Chemistry Conference 2018, 25.-29.06.2018, Halifax, Kanada

Auszeichnungen:

  • Auszeichnung für den besten Vortrag, 10. interdisziplinäres Doktorandenseminar, 29.02.2016, Berlin, Deutschland
  • Auszeichnung für das zweitbeste Poster, 13. Kolloquium Prozessanalytik, 20.-22.11.2017, Esslingen, Deutschland